过氧乙酸是一种普遍应用的、杀菌能力较强的高效消毒剂，具有强氧化作用，可以迅速杀灭各种微生物，包括病毒、细菌、真菌及芽孢。
过氧乙酸溶液容易挥发、分解，其分解产物是醋酸、水和氧，因此用过氧乙酸消毒液浸泡物品，不会留下任何有害物质。用过氧乙酸气体熏蒸消毒后，通风半小时，空气中的过氧乙酸就几乎全部分解、消散了，人们进入消毒后的房间不会受到伤害。因此，过氧乙酸可广泛应用于各种器具、空气、环境消毒和预防消毒。下面介绍几种正确的、常用的消毒方法：
浸泡：通常纺织品用浓度为0.04％的溶液浸泡2小时；餐具洗净后用0.5％的溶液浸泡30～60分钟；体温计用0.5％溶液浸泡15～30分钟；病人排泄物容器（便器、痰盂）用0.5％的溶液浸泡5小时；蔬菜、水果洗净后用0.2％的溶液浸泡10分钟。
擦拭：可用于消毒皮肤与污染的物品表面。将原液稀释成0.2％的溶液擦洗双手l～2分钟，再用清水洗净；如对物体表面进行消毒，可用浓度为0.2％～1％的过氧乙酸稀溶液，擦抹后保持30分钟，即能达到杀菌目的。
喷雾：将原液稀释至0.2％～0.4％，关闭门窗，采用气溶胶喷雾消毒方法，使其较长时间悬浮于空气当中，对空气中的病原微生物起到杀灭作用。此方法也适用于服装与大件物品表面的消毒。喷雾后密闭20～30分钟即可达到消毒目的，然后开窗通风15分钟后方可进入，以减少过氧乙酸给人体带来的刺激及不适感。
熏蒸: 使用原液或稀释2-3倍熏蒸,熏蒸时，常用浓度为1-3克／立方米,不用加热,过氧乙酸会通过空气自然挥发, 使其长时间悬浮于空气当中，对空气中和每个角落的病原微生物起到杀灭作用,熏蒸时间要3—8小时, 然后开窗通风15分钟后方可进入。
注意事项：
由于原液为强氧化剂，具有较强的腐蚀性，因此不可直接用手接触，配制溶液时应佩戴橡胶手套，防止药液溅到皮肤上。
对金属有腐蚀性，不可用于金属器械的消毒。
在做气溶胶喷雾时，操作者应佩戴防护面罩，也可采用口罩、帽子及游泳镜替代，不可直接对人喷洒。
如药液不慎溅入眼中或皮肤上，应立即用大量清水冲洗。
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