在梅雨季节这段时间里往往连续阴雨，出现雷雨和闷热天气，气压较低，养殖动物排泄物也增多，水质极易恶化，因此特别容易缺氧，同时因为高温和低氧，很容易引发药害事故。
在梅雨期出现病害问题，处理起来风险很大，养殖成本会大幅增加，严重者可能会损失很大。梅雨期池水缺乏足够光照，藻类生长不旺，甚至没有。养殖前期积累的残饵和粪便不断增多，又得不到充分分解而积累下来。所以此阶段水质容易恶化，出现水体浑浊、水色发暗、缺氧，甚至在下风处可闻到水有异味。
所以应做好如下工作：
1、经常开启增氧机，特别是晚上利后半夜。遇到阵雨、连续炎热或天气突变的情况，开机时间要延长，并配合使用“粒粒氧”。对虾养殖池，应尽可能2～3天使用一次。使用智能测水设备，对水质、溶氧进行监测，及时启停增氧机。
2、没有增氧机的池塘，建议每隔3～5天使用一次“粒粒氧”（在后半夜使用最佳），以增加池底溶氧，减少池底有害物产生。养殖密度较大、水质不稳定的，应增加使用频率。可能的话要经常加注一些新水，适当抬高水位，并尽可能地换掉池塘底层水。
3、改善底质，同时配合粒粒氧使用，每7～10天使用1次，能消除底部有机质分解产生的有害物，并能抑制病菌繁衍，保持底质良好，防止水质恶化。并选择在不下雨的上午使用1～2次EM菌调水。
4、绵绵阴雨，往往池水透明度不高。促进藻类生长，减少池水有机质含量，净化水质，防止水体水质恶化。养殖密度比较大、池水比较深的池塘，还应适当泼洒石灰乳，每亩1米水深使用4～5千克。方法是将生石灰化水后全池泼洒。这能起到防止水体因养殖动物大量呼吸作用、藻类光合作用弱导致的水体变酸。盐碱池、pH值高的池塘无须进行此处理。
5、注意天气变化，及时增氧换水。梅雨季节，天气常会出现反常，加之水温持续升高，水质易恶化，要及时开机增氧和适时换水来稳定养殖水体。尤其是养殖龙虾、河蟹的池塘，要定期使用微生物调控水体。
6、梅雨季节河蟹、龙虾、鱼等进入快速生长期，摄食量增大，要合理控料，补菌调水，定期解毒。同时做好增氧改底，内服保肝护肠，以提高鱼虾蟹的抵抗力。
7、加强日常管理定期消毒，做好防病工作。黄梅期温度高、湿度大，饲料易霉变，所以饲料应存放在阴凉干燥处。勤开增氧机，防止缺氧。
8、连续的阴雨加上适宜的水温，极易诱发鱼病，要加强监测，根据水体状况定期消毒。在快出梅时对塘口进行改底调水、解毒防病。
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